BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: cassava-v7.fasta 899 sequences; 669,368,850 total letters Query= Chromosome12:11064001-11065100 Length=1100 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Chromosome12 2032 0.0 >Chromosome12 Length=36115694 Score = 2032 bits (1100), Expect = 0.0 Identities = 1100/1100 (100%), Gaps = 0/1100 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTATTCTTTTTGTTGGCATAACGATTATGGCTTGTAATATTGGCACAAACTTTGTTTATT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064001 TTATTCTTTTTGTTGGCATAACGATTATGGCTTGTAATATTGGCACAAACTTTGTTTATT 11064060 Query 61 TCAATGTTAAACTTTTGTCTTTTGCTTGTCAAGGTGACTCCTGAAGATGTTCGTAAACTC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064061 TCAATGTTAAACTTTTGTCTTTTGCTTGTCAAGGTGACTCCTGAAGATGTTCGTAAACTC 11064120 Query 121 AATATTCCACCTGAATGTGTCAACAAAACTCCGTCTGGTGAAACATTTGTCAAATCAAAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064121 AATATTCCACCTGAATGTGTCAACAAAACTCCGTCTGGTGAAACATTTGTCAAATCAAAT 11064180 Query 181 TTACAAAAGGTTAAATCATGAATTTTTTTATAATCATTTTTATTGGTGTCATCATCATCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064181 TTACAAAAGGTTAAATCATGAATTTTTTTATAATCATTTTTATTGGTGTCATCATCATCT 11064240 Query 241 TGATTACCAGGATTAATTAGAATTATCTTTCAGGGAATTCTTCCTGAAATTCTTGAAGAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064241 TGATTACCAGGATTAATTAGAATTATCTTTCAGGGAATTCTTCCTGAAATTCTTGAAGAA 11064300 Query 301 CTATTAGCTGCTCGAAGAAGAGCAAAAGCAGATTTGAAGGTAATTATCTATTGTTTTGGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064301 CTATTAGCTGCTCGAAGAAGAGCAAAAGCAGATTTGAAGGTAATTATCTATTGTTTTGGC 11064360 Query 361 TGCTTTATTAAATGTTTGTATTTATTATTCCTTTGTGCATTGCTTATTATTCCTTTGTGC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064361 TGCTTTATTAAATGTTTGTATTTATTATTCCTTTGTGCATTGCTTATTATTCCTTTGTGC 11064420 Query 421 GTTGCCAATTTTTTACTCTGTTGTAATGTTACCGCTAGGTTTCTAGGCCTTTGTGCTTTT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064421 GTTGCCAATTTTTTACTCTGTTGTAATGTTACCGCTAGGTTTCTAGGCCTTTGTGCTTTT 11064480 Query 481 TATGATTTTATCTAATAATTTTAGGAAGCTAAGGATCCGCTTGTGAAGGCTGTTCTAGAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064481 TATGATTTTATCTAATAATTTTAGGAAGCTAAGGATCCGCTTGTGAAGGCTGTTCTAGAT 11064540 Query 541 GGTCGACAACTGGCCTTGAAGGTAAGCTTATAGATACATTGATCTGTCGATGCTCATTTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064541 GGTCGACAACTGGCCTTGAAGGTAAGCTTATAGATACATTGATCTGTCGATGCTCATTTT 11064600 Query 601 TAGTGTTCACAATCTATTTACTATCTAGTGAGGCCAAAGCTTATAGAAAGTTATACGCCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064601 TAGTGTTCACAATCTATTTACTATCTAGTGAGGCCAAAGCTTATAGAAAGTTATACGCCA 11064660 Query 661 TCAAGTGGATGGCCTCAAATGCTTTTAAAATATTATCTCTTTTCTCTTTAAAATTGATTG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064661 TCAAGTGGATGGCCTCAAATGCTTTTAAAATATTATCTCTTTTCTCTTTAAAATTGATTG 11064720 Query 721 AAATATTGAATTTTTGTTACTAAAAAATAAATATAAGTGATTAGTTAAAATTTAATGAAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064721 AAATATTGAATTTTTGTTACTAAAAAATAAATATAAGTGATTAGTTAAAATTTAATGAAT 11064780 Query 781 ACGTTGAATGAATTATTTCATTATATCCCAGAATATCTAACTTTGAGTTAAAGCTAACGT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064781 ACGTTGAATGAATTATTTCATTATATCCCAGAATATCTAACTTTGAGTTAAAGCTAACGT 11064840 Query 841 TTGTACTTCCCATATTTCTTTTTGTTAAGATTCAATAATTAGAAAATATATTTTAAAAAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064841 TTGTACTTCCCATATTTCTTTTTGTTAAGATTCAATAATTAGAAAATATATTTTAAAAAT 11064900 Query 901 AATGTTATTCTTAGATCAACTATTATTGCTTGAAACTTGTATTCTTTACTATTTTATATT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064901 AATGTTATTCTTAGATCAACTATTATTGCTTGAAACTTGTATTCTTTACTATTTTATATT 11064960 Query 961 CATGAAAGAATATTTAGCATTTCCATAAAGTGTATGGTCTTATCATCTTGGAAATTATTT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064961 CATGAAAGAATATTTAGCATTTCCATAAAGTGTATGGTCTTATCATCTTGGAAATTATTT 11065020 Query 1021 ATTTTTTTGTGATTAATATAATATTTTATGAAGTGTCTTTAAAATTTTCCCTCCCTTGGC 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11065021 ATTTTTTTGTGATTAATATAATATTTTATGAAGTGTCTTTAAAATTTTCCCTCCCTTGGC 11065080 Query 1081 TTCCCTTTTTGGTTATGTTA 1100 |||||||||||||||||||| Sbjct 11065081 TTCCCTTTTTGGTTATGTTA 11065100 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 716866116309 Database: cassava-v7.fasta Posted date: Oct 21, 2019 4:05 PM Number of letters in database: 669,368,850 Number of sequences in database: 899 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5