BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: cassava-v7.fasta 899 sequences; 669,368,850 total letters Query= Chromosome12:8345101-8346300 Length=1200 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Chromosome12 2217 0.0 >Chromosome12 Length=36115694 Score = 2217 bits (1200), Expect = 0.0 Identities = 1200/1200 (100%), Gaps = 0/1200 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTGCATCTTTATATCCTTCAATAATGATGGCATATAATCTATGTTACTGCACCTTGGTAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11063928 TTGCATCTTTATATCCTTCAATAATGATGGCATATAATCTATGTTACTGCACCTTGGTAA 11063987 Query 61 TAATCTTGACCATTTATTCTTTTTGTTGGCATAACGATTATGGCTTGTAATATTGGCACA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11063988 TAATCTTGACCATTTATTCTTTTTGTTGGCATAACGATTATGGCTTGTAATATTGGCACA 11064047 Query 121 AACTTTGTTTATTTCAATGTTAAACTTTTGTCTTTTGCTTGTCAAGGTGACTCCTGAAGA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064048 AACTTTGTTTATTTCAATGTTAAACTTTTGTCTTTTGCTTGTCAAGGTGACTCCTGAAGA 11064107 Query 181 TGTTCGTAAACTCAATATTCCACCTGAATGTGTCAACAAAACTCCGTCTGGTGAAACATT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064108 TGTTCGTAAACTCAATATTCCACCTGAATGTGTCAACAAAACTCCGTCTGGTGAAACATT 11064167 Query 241 TGTCAAATCAAATTTACAAAAGGTTAAATCATGAATTTTTTTATAATCATTTTTATTGGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064168 TGTCAAATCAAATTTACAAAAGGTTAAATCATGAATTTTTTTATAATCATTTTTATTGGT 11064227 Query 301 GTCATCATCATCTTGATTACCAGGATTAATTAGAATTATCTTTCAGGGAATTCTTCCTGA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064228 GTCATCATCATCTTGATTACCAGGATTAATTAGAATTATCTTTCAGGGAATTCTTCCTGA 11064287 Query 361 AATTCTTGAAGAACTATTAGCTGCTCGAAGAAGAGCAAAAGCAGATTTGAAGGTAATTAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11064288 AATTCTTGAAGAACTATTAGCTGCTCGAAGAAGAGCAAAAGCAGATTTGAAGGTAATTAT 11064347 Query 421 CTATTGTTTTGGCTGCTTTATTAAATGTTTGTATTTATTATTCCTTTGTGCATTGCTTAT 480 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cassava-v7.fasta Posted date: Oct 21, 2019 4:05 PM Number of letters in database: 669,368,850 Number of sequences in database: 899 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5